华柄数据
华柄数据服务平台,由原中国科学院科学数据库团队(原中国植物物种信息数据库建设团队)耗费近十年时间构建,是综合了数据智能与搜索、知识工程与语义识别、网页数据采集与复杂文本自动提取数据等技术开发而成。
一、网站介绍
网站名简称:华柄数据
数据服务:面向中医药大数据的大数据服务平台,以中医药大数据为核心,总数据量约450亿条(其中45亿条提供在线搜索服务),利用数据挖掘和数据架构技术,整合关联了包括互联网和公开出版物上的大量中医药专业数据,并与其他专业领域的相关数据智能整合,让药物(材)的数据多层次、多维度全面呈现;强大的搜索引擎,可自动集成、智能识别,满足用户的多条件精准搜索;为中药现代化研究水平的提高以及中药的传承、创新、发展,提供了全新的视角和全面的数据支撑。对中药现代化,新药研药(中成药、新药、组方)提供专业智能化数据信息服务。
网站内容包括物种数据库、中药数据网络、药物数据网络、方剂数据网络、公开数据、文献等。
中药数据网络,方剂数据网络、药物数据网络、物种大数据一起构成生物医药数据网络体系的核心数据服务。
二、网站特色
(一)、中药(材)
数据最全面、最专业
名称
|
靶点(个) |
与中药相关物种(个) |
中草药(个) |
方剂 |
中药相关名(个) |
中药核心数据(条) |
药物数据(条) |
开放数据(条) |
数量 |
6200 |
2.6万 |
4万 |
18万 |
16万 |
5900万 |
9800万 |
45亿 |
注:靶点数据包含:基因功能,基因序列,基因注释,基因相关药品,靶点相关反应蛋白。 条:指数据点。
(二)、唯一一个对药物(材)数据跨学科、多维度智能整合的网站
华柄数据(智能中医药大数据)是对中药学、化学制药、生物制药、分子生物学等相关学科中的药物数据进行甄别提取、智能整合而生成的,药物(材)的数据多层次全面呈现,而且高度关联。
(三)、可以站内、外无缝扩展链接,尤其是可以链接到世界四大顶级网站。
华柄数据(智能中医药大数据)中的数据点可以站内、外无缝扩展链接,包括世界四大顶级网站(DrugBank,PubMed,PubChem,Uniport),让用户查找站外相关数据更方便。
(四)、强大的智能搜索能力。
华柄数据(智能中医药大数据)可实现对输入的各种数据的自动识别:在海量数据(数千亿数据)中自动定位数据和关联数据。支持多条件搜索,可以得到精准的结果。如:
藏药抗病毒退热,就可以得到相应的中药条目白狼毒、蔓荆子、凤尾草等,点击中药名,就可以得到相应的中药数据。
(五)、弥补中医药信息化建设的不足,推动中医药行业发展。
通过华柄数据(智能中医药大数据)提供的多层次中药数据,中医药从业人员可以结合自己的实践,对中药进行多维度的深度探索,为发现中药新的使用方法或用途,为组成新的药方或发明新药提供灵感和思路,从而推动整个中医药行业的快速发展。
三、核心数据
(一)、中药大数据网络
涵盖了中医药及相关的大量专业数据。通过数据自动集成与相互关联,与国家西药处方用药数据进行对比,同时与中药现代研究的中药相关的基因、蛋白、代谢数据等现代生物医药知识结合,进行综合分析处理,再按照不同的需求将数据进行分类形成中医药智能网络。
数据来源:以生物医药知识结构与海量数据为基础,构建相互关联的生物医药知识网络与大数据网络。产品的知识信息和数据来源于互联网、国家及相关科研机构公开出版物中与生物医药相关的内容,包括但不限于基因及基因组数据,化学数据,分子及活性,蛋白质,药物及靶点数据,生理、病理、毒理、药理、基础医学、中药、文献等数据。
(二)、药物数据网络
集成中国药典2015,美国药典29版,马丁代尔药物大典37版,新编药物学,中国药学大辞典,中国药物大词典,DrugBank,Chembl,FDA,PubChem等。
(三)、物种数据网络
集成了中国植物志,云南植物志,Flora of Chia, Moss Flora of China, Flora of North America,Species2000,中国生物多样性红色名录,中国珍稀濒危植物名录,中国入侵植物,中国经济植物志,药用植物(来源于中药数据网络),观赏植物:2000种观花植物,中国自然标本馆图片;CNKI文献,pubchem文献,通过数据自动标注物种进行集成。
(四)、方剂数据网络(个人版)
中医方剂,是历代医家临床经验的结晶,是运用中医有关辩证论治理论指导临床防病治病的主要手段。纵观周秦以来,新方创制不断增加,载方文献汗牛充栋,组方理论渐趋完善,为炎黄子孙的健康和中华民族的繁衍昌盛,作出了巨大的贡献。[选自《中医方剂大辞典》]
方剂是一个复杂体系,符合疾病现代治疗学发展趋势,原创性思维与现代科学技术相结合就可形成原创性优势。
方剂数据网络(个人版)是以经典方剂大数据为基础(目前收集到18万个),集中医证候学、中药基础数据、中药药对、中西医病名对照、中药化学活性作用功能统计、药物、有毒活性成化、有毒活性统计、相似方剂,对方剂进行初步数据化解析,实现对特定方剂的评估、重新发现方剂内在价值、进一步组方、药物开发等。
(五)、公开数据
包括Pubchem化学数据、基因数据:Genbank、蛋白数据:Uniport Sport、基因本体:Go
(六)、文献
包括CNKI文献、NCBI PubMed